تراصف تسلسلي
في المعلوماتية الحيوية ، تعد طريقة التراصف التسلسلي واحدة من طرق ترتيب التسلسلات البدئية primary sequence للدنا و الرنا أو حتى البروتينات لتمييز المناطق ذات التماثل المرشحة لتكون نتيجة علاقة وظيفية او بنيوية أو تطورية بين هذه التسلسلات .
كما ان التسلسلات النيكليوتيدية المتراصفة أو سلاسل الحموض الأمينية المتراصفة تمثل في المعظم بصفوف ضمن مصفوفة. كما يتم إدخال فجوات بين الوحدات بحيث تكون الوحدات المتطابقة او المتشابهة متراصفة في اعمدة متعاقبة .
حيث انه إذا كان لدينا تسلسلين في تراصف ما يتشاركان ذات الأصل (السلف)، فإن التباينات mismatches يمكن ان تفسر على انها طفرات نقطية point mutation و ثغرات مثل إنديل (و هي طفرات إدخال أو إلغاء) يتم إدخالها في سلالة أو سلالتين بوقت واحد .
في التراصف التسلسلي للبروتين ، بالاستطاعة تفسير درجة التماثل بين الحموض الأمينية التي تحتل مكان محدد في تسلسل ما على انها مقياس تقريبي لكيفية انحفاظ منطقة معينة أو sequence motif بين السلالات . غياب الاستبدال أو وجود استبدالات منحفظة جدا فقط (كما في استبدال حموض أمينية لسلاسل جانبية لها خاصيات كيميائية حيوية متشابهة ) ضمن منطقة معينة من التسلسل ، كل هذا يقترح أن هذه المنطقة لها اهمية وظيفية أو بنيوية . و مع ان نيكليوتيدات الدنا و الرنا متشابهة مع بعضها البعض جدا أكثر من الحموض الأمينية ، فإن انحفاظ ازواج الأسس يمكن ان يشير إلى دور بنيوي أو وظيفي أيضا .
التراصف التسلسلي يمكن ان يستعمل كذلك لأجل التسلسلات اللاحيوية ، مثل تسلسلات الموجودة في اللغات الطبيعية أو في البينات الاقتصادية .
المراجع
mawsoati.com
التصانيف
معلوماتية حيوية علم الوراثة العرقي الحاسوبي العلوم البحته علم الوراثة